第三方协议书是合作双方达成一致并签署的重要文件，一旦丢失，可能会对合作项目产生不利影响，因此需要及时采取补救措施。下面将从以下几个方面介绍第三方协议书丢失后应该如何处理。

　　首先，应该迅速与合作方联系，告知协议书丢失的情况，并尽快提供一份复制件。如果对方也保存了一份协议书的复制件，那么可以请对方提供一份给予复制;如果对方没有保存复制件，可以请求对方重新签署一份新的协议书。

　　其次，如果协议书没有转化为电子文件形式并留有备份，那么这次事件也应当提醒我们，今后在签署重要文件时应尽量采用电子方式并进行备份存储，以防止丢失或损坏。通过使用电子签名和电子文档管理系统，能够更加方便地保存和获取相关文件，同时也能保证文件的安全性和完整性。

　　再次，如果协议书的丢失导致合作项目无法顺利进行，需要与相关方重新磋商并达成新的协议。这时候，需要重新评估双方的需求和利益，重新商定合作内容、时间和条件等。双方应尽量保持沟通畅通，以便达成新的一致。

　　最后，对于协议书丢失的原因需要进行反思和总结，并制定相应的预防措施。例如，在签署协议书时可以委托专业机构进行存档，并采取多份复制文件的方式，确保备份的安全性和准确性。此外，还可以考虑增加相关附属文件，以提供更多的证据和保障。

　　综上所述，第三方协议书丢失是一种不可预料的意外事件，但我们可以通过及时与合作方联系、补充复制件、加强电子化管理、重新磋商和总结经验教训等方式予以处理，以保证合作项目的顺利进行。同时，我们也应该从中吸取教训，加强对重要文件的管理和保护，以避免类似事件的再次发生。